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琼胶的生物合成及相关蛋白

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行业新闻
2019/09/12 11:40

与琼胶产量及凝胶强度相关的潜在转录本及蛋白标记物的表达分析

与琼胶产量及凝胶强度相关的潜在转录本及蛋白标记物的表达分析

红藻中琼胶的生物合成途径

  琼胶作为一种胶凝剂和增稠剂被广泛地应用于工业中,其供应量在很大程度上取决于天然海藻的采收及海藻养殖。选择琼胶产量高、凝胶强度强的优良海藻资源具有重要意义,传统的鉴定方法涉及琼胶提取、凝胶强度分析等步骤,具有繁琐、费时费力的缺点,相比之下,分子标记法能够快速准确地做出判断。本文以江蓠属红藻为研究对象,分析其中与琼胶产量及凝胶强度相关的潜在转录本及蛋白的表达情况,以期获得分子标记物。基于文献检索,共筛选出15种与预测的琼胶生物合成途径直接或间接相关的候选转录本。其中有4种和11种候选转录本的转录丰度分别与6个江蓠属样本的琼胶含量和凝胶强度显著相关(P < 0.05),在这些基因中,编码果糖-1,6-二磷酸缩醛酶(GcFBPA)和尿嘧啶二磷酸半乳糖-4-差向异构酶(GcGALE)的基因转录水平与琼胶含量和凝胶强度均具有最高的相关性。进一步检测了13个江蓠属样本的蛋白丰度,发现GcFBPA和GcGALE分别与凝胶强度和琼胶含量呈高度相关性(P < 0.01)。综上,GcFBPA和GcGALE作为分子标记物在筛选优良的江蓠属红藻资源方面具有广阔的应用前景。

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